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在一般的储存条件下，双 (叔丁基二甲基硅基)- 反式 - 钙泊三醇具有较好的化学稳定性。硅基保护基团能够抵御一些常见的化学试剂和环境因素的影响，使分子在一定时间内不易发生分解或变质反应。然而，在特定的条件下，如在强酸性或强碱性环境中，硅基保护基团可能会发生水解或脱保护反应，从而改变分子的结构和性质。
对光的稳定性相对一般，由于双(叔丁基二甲基硅基)-反式-钙泊三醇分子中含有多个双键结构，在光照条件下，尤其是紫外光照射时，可能会发生光化学反应，如双键的异构化、光氧化等反应，导致分子结构的改变，因此，在储存和使用过程中，通常需要避光保存，以确保其结构和性质的稳定性。